Spesso MySQL viene installato settando come non attivo il supporto a InnoDB.
Se il proprio database è gestito da  un provider terzo, bisogna affidarsi al buon cuore di quest’ultimo (difficile che lo faccia).
Ma se siamo noi a poter mettere le mani sul server, per attivarlo basta seguire questi pochi passaggi

1. Aprire il file delle opzioni MySQL, il file si chiama my.cnf (in Linux) – lo trovi in /etc/my.cnf – o my.ini (in Windows) – lo trovi in c:/windows/my.ini –
2. Trova l’istruzione skip-innodb e commentala aggiungendo # prima di essa
3. E’ consigliato incrementare il valore max_allowed_packet per essere sicuri di poter uploadare file più grandi di 1 MB.
   Quindi subito sotto la linea appena commentata scriviamo:
   set-variable = max_allowed_packet=64M

Link: MySQL